В 2007 году в семье родился сын Иван. Вскоре после его рождения у Анастасии был обнаружен рак мозга. Супруги начали активное лечение. Актер распродал все имущество, влез в долги, соглашался на любую роль. Но лечение не помогло. В декабре 2008 года Анастасия умерла. Смерть супруги стала настоящим ударом для Константина. После трагедии актер основал свой собственный благотворительный фонд, который помогает детям больным онкологией. В 2013 году Хабенский женился на актрисе Ольге Литвиновой. В 2016 году у супругов родилась дочь Александра.